החשבת הכללית במשרד האוצר מיכל עבאדי בויאנג'ו מינתה את עמוס שקדי לתפקיד חשב משרד הביטחון, במקום צחי מלאך שהתמנה מנכ"ל חברת אשרא, לביטוח סיכוני סחר חוץ.

שקדי, שימש עד היום סגן בכיר לחשבת הכללית – מנהל חטיבת משרדים ביטחוניים ומינהליים. במסגרת תפקידו הוביל, בין היתר, את הליך השקיפות והבקרה על תקציב משרד הביטחון והשתתף כמשקיף בוועדת לוקר לעניין תקציב הביטחון.

שקדי החל את עבודתו באגף החשב הכללי בדצמבר 1999. הוא שימש במשך השנים חשב משרד התמ"ת (הכלכלה), חשב החטיבה להתיישבות, סגן חשב משרד התחבורה, רכז ורפרנט תחבורה ותקשורת באגף החשכ"ל.

לשקדי תואר ראשון ושני בכלכלה מהפקולטה לחקלאות מהאוניברסיטה העברית.

החשבת הכללית, מיכל עבאדי בויאנג'ו: "לחשב משרד הביטחון משמעות רבה בניהול תקציב הביטחון, שהוא התקציב הגדול ביותר מבין משרדי הממשלה. צפויים לעמוס אתגרים רבים ואני בטוחה שהוא יעשה את העבודה באופן הטוב ביותר. אני מאחלת לשקדי הצלחה בתפקידו".