עקב שינויים בלוחות הזמנים, נוסעי רכבת ישראל מתבקשים להתעדכן בזמני הנסיעות המדויקים באתר הרכבת, באפליקציה ובמוקד השירות בטלפון 5770*. במהלך חגי תשרי יופעלו הרכבות על פי לוח זמנים ייעודי, הכולל שינויים בלוחות הזמנים ורכבות נוספות על פי הצורך.

ראש השנה: בערב ראש השנה תופעלנה רכבות הנוסעים על פי לוחות זמנים של ימי שישי. בנוסף, תופעל רכבת תגבור מיוחדת בשעה 08:45 מתחנת באר שבע מרכז לתחנת ת"א סבידור-מרכז.

יום הכיפורים: בערב יום הכיפורים, תסתיים תנועת הרכבות מוקדם מהרגיל. עד לשעה 11:00 (לערך) תופעלנה הרכבות על פי לוח הזמנים הרגיל של יום שישי. החל משעה 11:00 (לערך) ועד לשעה 14:00 בקירוב, תסתיים תנועת הרכבות בהדרגה.

במוצאי יום כיפור, לא תופעלנה רכבות, פרט לרכבת היוצאת מתחנת באר שבע מרכז לתחנת נהרייה בשעה 23:46. תנועת הרכבות תחודש לאחר חצות.

סוכות ושמחת תורה: בערב סוכות (יום רביעי), תופעלנה הרכבות על פי לוח הזמנים של ימי שישי.

בערב החג (יום רביעי), במהלך יום שישי (היום הראשון של חול המועד) ובערב שמחת תורה:
• תופעל רכבת תגבור מיוחדת בשעה 08:45 מתחנת באר שבע מרכז לתחנת ת"א סבידור-מרכז.
• הרכבות מתחנת ת"א סבידור מרכז לתחנת ירושלים מלחה, היוצאות בשעות 10:21 ו- 11:21, תעצורנה גם בתחנת ירושלים גן החיות התנ"כי )תיגבור זה יופעל גם באיסרו חג בתאריך 27.9)

במהלך חול המועד, בימים א' 22.9.2013 עד ג' 24.9.2013 (כולל), תתוגברנה רכבות הנוסעים בקווים הבאים:

• בנימינה – רחובות
• חיפה – מודיעין
• תל אביב – ירושלים