התכנון, שנוסח במסמכים רשמיים של אגף כוח האדם, כולל פינוי של בסיסי הכליאה הקיימים והעברת הכלואים בהם לכלא אחד. בצה"ל מעריכים, כי הקמת בסיס הכליאה החדש עדיפה על חיזוק התשתיות הקיימות בבסיסי הכליאה הנוכחיים. נוסף לכך, הקמת הכלא החדש תהלום את הצורך לצמצם את פריסת בסיסי צה"ל ותחסוך עלויות. במסגרת בחינת הקמת בסיס הכליאה הזה, נבחנת התאמת המענה הכליאתי לסטנדרטים הנדרשים.

בתוך כך, בוחנים באגף כוח האדם את הקמתו של הכלא בסמיכות לקרייה משפטית, כך שתיווצר יעילות ארגונית ויצטמצם פער הזמנים בין מעצר, משפט וההעברה של הכלוא לבסיסי הכליאה. לדברי גורמים בכירים במשטרה הצבאית, המיקום המועדף לכלא המרכזי הזה כרגע הוא באזור בית נחמיה (בית נבאללה), במקום שהוקם לא מזמן חדר המשמר של אט"ל, הבנוי להכיל כ-24 חבושים מהיחידה, שנשפטו לעונשים של עד 28 ימי מחבוש.

בימים אלה נמצא הרעיון בתהליך אישור פרויקט מול אגף התכנון, וטרם נמצא מקור מימוני, אשר יאפשר את הקמת הכלא בקרבה לקרייה משפטית והעברת הכלואים למקום שייקבע. כשזה ימצא, ניפרד מכלא 6 המיתולוגי.